Более короткая шея перемещает мостик ниже на деки и немного меняет тон.
Кроме того, у большинства 12 ладов более широкое расстояние у гайки и более широкое расстояние между струнами у моста, что лучше для стиля пальцев.
Вырез - это своего рода личный выбор, но ИМХО, вырезы выглядят не так, как на 1000-12 ладу. Опять же, просто личные предпочтения.
Если вы не играли на 12 ладов, вам действительно нужно найти их, чтобы вы могли сами почувствовать разницу.